In the begining there was Void... Then four spirits came Together in the Void... The crystals where born, And the world was created...	When the day come that Void Shall again evelop the world... In within the people live the four spirits, Light shall again be born.
Thus, Hope give the Earth blessings, Courage lights the flame, Kindness makes water source of life, And... Pursuit lets wisdom ride the wind.	Four spirits, Wandering throught Void Shall once again, Give birth to light..

O mundo de repente é tomado de assalto por meteoros que caem trazendo desgraças.
Um aventureiro, uma princesa, uma pirata, e um velho com amnésia investigam a quebra dos cristais elementais. Após várias falsas descobertas, o grubo descobre que os meteoros vem de outro mundo, eles entrem em uma Warp, viajam para o outro mundo e encontram a ameaça Exdeath e seu braço direito Gilgamesh. O grupo encontra-se com os quatro bravos da Aurora, trinta anos atrás eles aprisionaram Exdeath dentro de uma árvora, mas o feitiço tornou-se fraco, o grupo enfrenta Exdeath e Galuf sacrifica-se, sua neta Kururu (Kara), eles então novamente enfrentam Exdeath, mas ele funde os dois mundos em um, e nele Exdeath bane cidades inteiras com o poder do "MU" (Void) enquanto o grupo busca oito armas sagradas, ao fim o grupo vai ao Cleft of Dimension determinado a acabar com Exdeath de uma vez por todas. O grupo é formado por um aventureiro chamado Butz, que viaja pelo mundo com seu amigo chocobo, Lenna é uma princesa que sempre viveu no reino de seu pai Tycoon, mas teve que partir quando seu pai sumiu após investigar a perda de força do cristal de vento. O grupo também encontra a irmã desaparecida de Lenna, Faris, uma mulher que esconde sua identidade, passando-se por homem frente ao grupo de piratas que comanda, Galuf é um homem com amnésia e sua neta Kururu (Kara) é encontrada mais tarde.